IsoLight e IsoSpark

IsoLight e IsoSpark

I sistemi Isoplexis sono delle piattaforme completamente automatizzate per l’analisi proteomica in bulk e a singola cellula. Entrambi i sistemi, IsoLight e IsoSpark, racchiudono all’interno tutta la pipeline di proteomica, limitando al minimo l’intervento dell’operatore e, di conseguenza, anche la variabilità dovuta all’utente. Le due piattaforme sono dotate di:

• Laser multicolore per imaging di precisione di ogni cellula attraverso la fluorescenza superficiale, consentendo il rilevamento quantitativo di proteine ​​associate a ogni singola cellula.
• Sistema di incubazione per mantenere le cellule in condizioni fisiologiche.
• Cella di flusso abilitata per la fluidica per portare reagenti ELISA della massima qualità con un flusso uniforme in modo completamente automatizzato, massimizzando la riproducibilità.
• Strumento software efficiente con grafici avanzati per facilitare l’interpretazione dei dati e funzionalità di esportazione.

Il sistema IsoLight, il primo uscito, permette di alloggiare 8 chip per volta, indipendentemente dalla tipologia, mentre IsoSpark, uscito a fine 2020, concentra le stesse performance dell’IsoLight in un sistema più compatto, che gestisce 4 chip alla volta.

Applicazioni

La grande mole di informazioni che i sistemi Isoplexis rendono disponibili trovano applicazione in molti settori delle scienze della vita e cliniche. Il numero di pubblicazioni è in continua crescita, così come gli ambiti in cui questa tecnologia sembra avere un impatto.
Principali aree di ricerca:

• Immuno-oncologia
• Terapia cellulare
• Malattie Infettive
• Infiammazione
• Terapie target

Software

Il software IsoSpeak è studiato per rendere l’esperienza dell’utente estremamente semplice, rendendo facilmente accessibili ed in risalto i dati più rilevanti. I chip e i relativi pannelli vengono automaticamente riconosciuti dal sistema mediante il codice a barre, il software rende disponibili le funzioni rilevanti associate a quel tipo di analisi.
Opzioni di visualizzazione:

• Polyfunctional Strength Index: molto spesso la maggior parte delle cellule ha un profilo funzionale limitato all’espressione di una o poche molecole, al contrario un piccolo gruppo di cellule mostra un’elevata “polifunzionalità”, spesso direttamente responsabile della risposta. Questa visualizzazione permette di concentrare l’analisi laddove la polifunzionalità è elevata, osservando le differenze tra campioni.
• Polyfunctional Heat Map: con questa visualizzazione si possono individuare le molecole responsabili della polifunzionalità di alcune cellule
• 3D Cytokine Mapping PCA e tSNE: visualizzazione che permette di segmentare a raggruppare assieme campioni con profili simili e individuare così le differenze funzionali associate a diversi profili

Con IsoSpeak non è necessario essere un bioinformatico per navigare nella proteomica, l’interfaccia intuitiva facilita l’utente sia nella selezione dei dati da visualizzare, che nella presentazione grafica più adeguata a fornire una risposta alla domanda scientifica posta.

Esempio di output per analisi di secretoma single-cell.

Chip Isocode: chip single-cell

Con il chip Isocode è possibile:

• ottenere i livelli di espressione di più di 30 molecole per ogni singola cellula
• scegliere tra i diversi pannelli a disposizione (Innate Immune, Adaptive Immune, Cytokine Storm,..)
• analizzare per ogni campione in media 1000 cellule, ottienendo più di 30.000 datapoints per campione
• scegliere tra saggi di secretoma oppure di signaling intracellulare, sempre su singola cellula

Chip Codeplex: chip ELISA miniaturizzati e multi-plex

Con il chip Codeplex è possibile:

• effettuare uno screening dei livelli di più di 30 molecole in parallelo, con solo 5,5 ul di campione
• effettuare un saggio completamente automatizzato, minima variabilità dovuta all’utente
• aggiungere semplicemente il tuo campione e allontanati, ottenendo dati completamente analizzati il giorno stesso. Niente più stazioni di lavaggio e incubazione ELISA, niente centrifuga, nessun vortex e nessun lettore di piastre. Tutte le tue esigenze proteomiche sono integrate nel sistema di Isoplexis completamente automatizzato.

Le piattaforme Isoplexis permettono di effettuare saggi di secretomica/proteomica su singola cellula e saggi ELISA miniaturizzati in multi-plex utilizzando lo stesso strumento.